Jordbrugs- og fødevareforskningen finansieres via forskellige kilder, hvor DCA’s kontrakt med Miljø- og Fødevareministeriet udgør en grundsøjle. Ifølge aftalen modtog DCA i 2017 ca. 262,3 mio. kr. til opgaven.
Med bevillingen fra Miljø- og Fødevareministeriet er det muligt for DCA at tiltrække og gennemføre forskningsprojekter i samarbejde med organisationer og virksomheder.
Dette samarbejde er sammen med bevillinger fra nationale fonde og forskningsprogrammer hovedårsagen til, at den samlede forsknings- og udviklingsindsats på jordbrugs- og fødevareområdet lå på 658 mio. kr. i 2017.